南通港位于長江下游北岸，江蘇省東部的南通市境內，東瀕黃海、南臨長江，是長江下游唯一處于蘇中、蘇北地區的大型港口，為國家一類對外開放口岸，國家主樞紐港，也是上海國際航運中心組合港的主要成員。港口沿長江上溯至南京253.7千米；下行至吳淞口96.3千米，長江入海口195.5千米，地理位置非常優越，是理想的大宗貨物中轉集散中心。

南通港長江段岸線區域自如皋又來沙四號港閘至海門港閘。港口處于江、河、海聯運的樞紐地位，東出長江入海可以與我國南北沿海各港口和世界各港通航；上溯長江，可聯系蘇、皖、贛、鄂、湘、川6省內河通過港口引河與通揚、通呂運河等蘇北水系和京杭大運河貫通。陸路與國道204、寧通、通鹽、通啟和G15、G40高速公路連接。南通興東民航機場距港區僅20千米，目前已開辟了至北京、廣州、深圳、大連、廈門、南京等地的定期航班，海、陸、空立體交通運輸的新體系已經形成。

該港現轄如皋、天生、南通、任港、狼山、富民、江海、通海等8個沿江港區和呂四、洋口2個沿海港區，有生產用碼頭泊位109個，碼頭岸線總長17540米，其中萬噸級以上碼頭泊位54個。

如皋港區位于如皋港經濟開發區岸線內，上界自如皋又來沙四號港聞，下界至洪北沙西南角，擁有可利用岸線3000米～4000米，陸域縱深1200米～1500米。主要為如皋經濟開發區招商引資和工業開發服務，是承擔油品、液體化工及散雜貨儲運為主的港區。

天生港區上界自小李港，下界至通呂運河口，岸線長約7500米，陸域縱深1200米。主要承擔煤炭、雜貨運輸任務，為電廠、港閘開發區和臨港工業服務。主要有天生港電廠、華能電廠、熱電廠、建材廠、越江港務等千噸級長江碼頭和通呂散貨碼頭、通沙碼頭

南通港區上界自通呂運河口，下界至南通糧油進出口接運公司與中遠南通船廠的分界線，岸線長約1400米，陸域縱深500米～800米，是主要承擔散雜貨運輸并兼顧客運的公用港區。

任港港區上界自南通糧油進出口接運公司下游側，下界至姚港河口，岸線長約2400米，陸域縱深500米～800米，是主要為船舶工業服務的臨港工業港區。

狼山港區上界自姚港河口，下界至狼山龍爪巖取水口上游1千米處，岸線長約3250米，陸域縱深700米～1200米，是以承擔大宗散貨、集裝箱以及散雜貨運輸為主的綜合性港區，包括姚港、狼山、集裝箱3個港務公司。

富民港區上界自庫子港河口，下界至老洪港風景區上游段，岸線長約4500米，陸域縱深800米，是承擔雜貨、液體化工為主的港區，主要為國家級南通經濟技術開發區服務。

江海港區上界自老洪港風景區下游段，下界至東方紅涵洞，岸線長約5200米，陸域縱深1200米，是以承擔原材料、成品油及液體化工運輸為主的公用港區。

通海港區上界自東方紅函洞，下界至海門港間，規劃岸線長約10千米，其中約5千米沿岸的水深可達20米，陸城縱深1500米，是以集裝箱、大宗散貨為主的綜合性港區。

呂四港區為利用大洋港外小洪深水槽內建設的深水泊位港區，大電廠在該港區內建有煤炭專用泊位。

洋口港區為利用爛沙洋深槽建設的深水泊位港區，以公用碼頭和臨港工業的頭為主。

南通港港口設施齊全，助航標志完善，港域寬闊、水深，萬噸級船舶四季均能通航。船舶裝卸貨物以靠泊碼頭作業為主，同時也可進行過駁作業。目前，南通港擁有長江沿線最為先進的散貨作業系統，噸位最大的散貨碼頭，面積最大的長江港池，已成為長江沿線最大的礦石中轉基地，最大的大豆、菜籽進出口基地。

南通港是我國長江下游對外貿易口岸和進出口物資江海中轉主樞紐港之一，上海國際航運中心組合港之一，擔負著南通市和蘇北地區內、外貿易運輸，長江中、上游大宗散貨的中轉和外貿進出口運輸及旅客運輸。作為我國首批對外開放港口，目前已與日本、美國、歐洲、香港等100多個國家和地區的300多個港口通航。南通港地處長江入海口，背靠蘇北平原，有著十分廣闊的經濟腹地，是江蘇省中部重要的經濟發展地區，中轉腹地為長江沿線的6省1市，同時還涉及云、貴、豫、陜等省，進出港的主要貨種為煤炭、金屬礦石、鋼鐵、礦建材料、水泥、化肥、木材、棉花、糖、雜貨等。2014年，港口完成貨物吞吐量2.16億噸，其中外貿貨物吞吐量4813.6萬噸，集裝箱吞吐量71.1萬標準箱。